有關四月二日及十五日肉毒桿菌中毒事件，經桃園縣政府衛生局及雲林縣衛生局抽驗有關產品工廠抽驗之檢體（14件），經由衛生署食品藥物管理局檢驗，均未檢出肉毒桿菌毒素及肉毒桿菌細菌（如附件）。本案由於病患已呈現中毒現象，檢體侷限於患者本身，而食材中之肉毒桿菌污染食品必須在一定條件下才會繁殖生長，進而產生毒素，加上細菌污染的不均勻性與患者回憶食材的困難，且未能採得患者當時所食用之食品，皆有可能導致無法自採樣之檢體中驗出肉毒桿菌及其毒素，故依目前掌握的檢體，本案肉毒桿菌中毒之原因食品不明。惟為確保民眾食的安全，該局將責成地方衛生局，加強輔導真空包裝產品製程改善並宣導食品安全。案內二家廠商，經衛生局查核符合食品良好衛生規範後，即可復工。
真空包裝食品在缺氧環境、滅菌不全及保存不當下是肉毒桿菌生長及產生毒素的條件，目前已由縣市衛生局針對相關食品製造業者之衛生環境進行稽查，並輔導改善以符合食品良好衛生規範。另外，針對真空包裝即食食品除進行衛生管理以防止源頭受到污染之外，亦將輔導業者採用降低產品酸鹼值、提高鹽度、降低水活性、降低溫度等加工方式，預防肉毒桿菌生長。
食品藥物管理局再次呼籲，民眾選購罐頭、真空包裝等食品時，應選擇信譽良好之商家，並依標示妥善儲存，切勿購買來路不明且未完整標示之食品。如發現上述食品有膨罐或脹氣及有異味的情形，千萬不要食用，以確保食用安全。另外，提醒國人如發現有視覺障礙、吞嚥困難、口乾及眼皮下垂等疑似肉毒桿菌毒素中毒症狀，應儘速就醫，以保障生命安全。肉毒桿菌食品中毒與防治之相關資訊，得逕上衛生署食品資訊網（http://food.doh.gov.tw/）或疾病管制局網頁（http://www.cdc.gov.tw/）查詢。