食品藥物管理局於年 (99) 初即將涼麵之衛生安全列為年度重點稽查工作，各縣市稽查各種業別 (包括便利商店、大賣場、超級市場、一般餐飲店及攤販) 營業場所販賣之涼麵，1～6 月兩季共稽查涼麵業者 2,576 家數；抽驗涼麵 817 件，10 件不合格，統計各衛生局所回報之稽查結果顯示，第二季稽查各種業別之涼麵不合格率由 0.3% 增加至 4.5% ，可能與夏季天氣炎熱，氣溫升高，微生物容易滋長有關。
本局呼籲消費者購買涼麵時，應注意此類產品是否儲放於冷藏設施、餐飲從業人員是否帶手套或口罩等衛生細節，並於購買後儘快食用，以確保產品安全無虞。
針對中華民國消費者文教基金會 (以下簡稱消基會) 抽驗 12 家傳統涼麵業者調查發現涼麵生菌數超過衛生標準乙事，本局由衷感謝消基會持續關心食品安全議題，亦立即再度責成各縣市衛生局持續針對涼麵製造、販售環境衛生加強稽查，並輔導業者設置冷藏設施，如發現確有不符合衛生標準之情事，將依法嚴加處辦，以具體落實食品良好衛生規範，本局也將由區管中心於北、中、南三區加強稽查，俾便保障民眾食用安全。