史瓦帝尼

1. 【出訪】本署林副署長奏延陪同馬總統英九於2012年4月7-18日率團赴訪非洲3友邦布吉納法索、甘比亞共和國及史瓦濟蘭王國進行國是訪問「仁誼專案」。
2. 【訪臺】2012年11月14-16日，史瓦濟蘭衛生部政務次長Dr. Steven Shongwe來臺參加「2012年臺灣健康論壇」。
3. 【訪臺】2014年11月29日- 12月3日，史瓦濟蘭衛生部部長Sibongile Simelane偕資深行政官Duduzile Mbuli及機要秘書Mbali Nkambule等3位來臺參加「2014年臺灣全球健康論壇」。
4. 【訪臺】2015年10月31日- 11月4日，史瓦濟蘭衛生部部長Sibongile Simelane偕常務次長Khabonina Mabuza及資深行政官Duduzile Mbuli等3位來臺參加「2015年臺灣全球健康論壇」。
5. 【訪臺】2016年10月22-23日，史瓦濟蘭衛生部部長Sibongile Simelane 偕部長兒子、史國大學衛生學院院長Nonhlanhla Alucia Sukati 及衛生訓練官Mandla Dlamini等4位來臺參加「2016年臺灣全球健康論壇」，並與諾魯、索羅門群島、馬紹爾群島、吐瓦魯等國之衛生部部長共同參加部長圓桌會議。
6. 【訪臺】2017年10月22-23日，史瓦濟蘭(現稱史瓦帝尼)衛生部部長Sibongile Simelane、史國大學衛生學院院長Nonhlanhla Alucia Sukati及史國大學衛生學院護理長Gladys Thembisile Khumalo等3位來臺參加「2017年臺灣全球健康論壇」，並同參與部長圓桌會議。
7. 【出訪】2018年4月17-21日，本部何次長啟功隨蔡英文總統出訪非洲友邦史瓦帝尼，進行醫衛合作與交流。
8. 【訪臺】2018年10月28-29日，史瓦帝尼衛生部政務次長Dr. Simon Zwane來臺參加「2018年臺灣全球健康論壇」，並參與部長圓桌會議。
9. 【訪臺】2019年3月20日，史瓦帝尼衛生部長Ms Lizzy Nkosi訪臺並拜會本部陳部長，就臺史醫療合作、全民健保及傳統醫藥等議題進行討論。
10. 【訪臺】2019年10月20-21日，史瓦帝尼衛生部政務次長Dr. Simon Zwane來臺參加「2019年臺灣全球健康論壇」，並參訪本部桃園醫院、臺安醫院、臺北醫學大學附設醫院等。
11. 【訪臺】2022年10月30-31日，史瓦帝尼衛生部部長Lizzie Nkosi與藥政處副處長Fortunate Bhembe來臺參加「2022年臺灣全球健康福祉論壇」，並共同參加部長圓桌會議。

衣索比亞

1. 【出訪】2019年12月21-25日，本部何啟功次長率團參訪衣索比亞，拜會衣國衛生部及Tigray省等，就未來合作事宜進行討論，並參訪Ayden Comphrensive Referral Hospital與Tigray Health Research Institute等機構。

索馬利蘭

1. 【訪臺】2022年7月12日索馬利蘭衛生發展部執行長Dr.Mohamed Abdi Hergeye、政策規劃與資訊策略司司長Saeed Mohamood Soleman、醫療服務司副司長Abdiqani Hassan Abdirahman、醫院司醫院組負責人Suad Ibrahim Abdilahi、哈爾格薩總醫院院長Ahmed Omar Askar等官員參訪本部桃園醫院，了解該院醫療資訊系統之發展與運用情形，以及運用醫療資訊系統改善流程之經驗等。

非洲地區雙邊合作計畫

1. 2014年 1月1日- 12月31日，屏基醫療財團法人屏東基督教醫院執行南部非洲移動族群中愛滋病、肺結核、高血壓病患管理提升計畫。
2. 2015年 1月23日- 12月31日，屏基醫療財團法人屏東基督教醫院委託辦理推展非洲地區國家衛生醫療合作計畫。
3. 2016年1月1日- 12月31日，屏基醫療財團法人屏東基督教醫院執行馬拉威健康科學研發能力建構整合型研究計畫(延續型)。
4. 2017年1月17日- 12月31日，國立成功大學醫學院附設醫院執行推展非洲地區國家(肯亞)衛生醫療合作計畫(延續型)。
5. 2017年1月17日- 12月31日，屏基醫療財團法人屏東基督教醫院執行接軌全球永續發展暨非洲馬拉威健康資訊系統強化合作計畫(延續型)。
6. 2017年1月17日- 12月31日，衛生福利部臺中醫院執行推展非洲地區迦納國家醫療衛生合作計畫(延續型)。
7. 2018年3月20日- 12月15日，屏基醫療財團法人屏東基督教醫院執行接軌全球永續發展與全民健康覆蓋目標：非洲馬拉威醫療品質提升與健康資訊系統強化合作計畫(延續型)。
8. 2018年3月20日- 12月15日，衛生福利部臺中醫院執行推展非洲地區迦納國家衛生醫療合作計畫(延續型)。
9. 2018年3月20日- 12月15日，國立成功大學醫學院附設醫院執行推展非洲地區國家(肯亞)衛生醫療合作計畫(延續型)。
10. 2019年2月11日- 12月31日，屏基醫療財團法人屏東基督教醫院執行接軌全球永續發展與全民健康覆蓋目標：非洲馬拉威醫療品質提升與健康資訊系統強化合作計畫(延續型)。
11. 2019年5月23日- 12月31日，衛生福利部臺中醫院執行推展非洲地區迦納國家衛生醫療合作計畫(延續型)。
12. 2019年2月11日- 12月31日，國立成功大學醫學院附設醫院執行推展非洲地區國家(肯亞)衛生醫療合作計畫(延續型)。
13. 2020年4月1日- 12月15日，衛生福利部臺中醫院執行推展非洲地區迦納國家衛生醫療合作計畫(延續型)。
14. 2020年3月10日- 12月15日，屏基醫療財團法人屏東基督教醫院執行接軌全球永續發展與全民健康覆蓋目標：非洲馬拉威醫療品質提升與健康資訊系統強化合作計畫(延續型)。
15. 2021年2月17日- 12月15日，屏基醫療財團法人屏東基督教醫院執行接軌全球永續發展與全民健康覆蓋目標：非洲馬拉威醫療品質提升與健康資訊系統強化合作計畫(延續型)。
16. 2021年2月9日- 12月15日，衛生福利部臺中醫院執行推展非洲地區迦納國家衛生醫療合作計畫(延續型)。
17. 本部臺中醫院與迦納Korle Bu Teaching Hospital以視訊方式辦理第五屆「臺灣－西非健康論壇」，我國由疾病管制署羅一鈞副署長擔任專題講者，迦國則由總統健康特別顧問Nsiah Asare擔任專題講者，臺灣、迦納、賴比瑞亞、象牙海岸等亦有講者出席，總計約503名人員線上報名參加。
18. 2022年3月8日- 12月15日，屏基醫療財團法人屏東基督教醫院執行接軌全球永續發展與全民健康覆蓋目標：非洲馬拉威醫療品質提升與健康資訊系統強化合作計畫(延續型)。
19.  2022年3月14日- 12月15日，衛生福利部臺中醫院執行推展非洲地區迦納國家衛生醫療合作計畫(延續型)。
20. 2023年4月20日- 12月15日，國立成功大學醫學院附設醫院執行「非洲（肯亞）醫療衛生合作計畫」（延續型）。
21. 2023年4月17日- 12月31日，屏基醫療財團法人屏東基督教醫院執行「後新冠疫情時代非洲地區（馬拉威）國際醫療衛生合作強化具韌性之當地健康資訊系統及新模式人才培育計畫」（延續型）。
22. 2023年5月2日- 12月15日，衛生福利部臺中醫院執行「112年度推展西非地區（迦納）醫療衛生合作計畫」（延續型）。
23. 2023年4月20日- 12月15日，高雄醫學大學附設中和紀念醫院執行「深化我國與索馬利蘭醫療公衛交流計畫」。