依健保署統計資料顯示，雖預估105年度當年健保財務收支會出現約40億元入不敷出之情形，但截至105年5月底止，全民健保安全準備總額已達2,290億元，額度約當5個月醫療給付，可充分供應收支不足的費用，故財務仍相當穩定。衛福部表示，若依現行費率(一般保險費費率4.69%，補充保險費費率1.91%)，現有的安全準備存量足以支應當前之醫療給付支出，至109年累計的收支都還不會有赤字出現，目前尚無調整費率之迫切性。不過因為影響健保財務因素很多，該部仍須密切注意財務趨勢，也會盡力朝費率穩定的方向努力。

衛福部同時表示，二代健保實施後，保險費率有其法定審議機制，依健保法第24條規定，應由保險人於健保會協議訂定醫療給付費用總額後1個月擬訂保險費率方案提請審議；並於年度開始1個月前依協議訂定醫療給付費用總額，完成該年度收支平衡費率審議，報主管機關轉報行政院核定後由主管機關公告之。依照上述程序，健保署將於106年度醫療費用總額完成協定後，提出該年度之保險費率方案，送健保會審議，衛福部亦會尊重健保會的審議權責。