本處前身為行政院衛生署資訊中心，於75年6月以臨時任務編組報院核准設置。初期以推動行政業務電腦化、促進行政效率、提升工作品質為主要任務。 

因應網路科技之發展，為提升行政效能與便民服務品質，本處推動全國衛生局所整合網際網路應用，強化公共衛生線上服務與資訊化建設，以及建立我國醫療院所電子病歷基礎環境。 

• 網路健康服務推動計畫（計畫期程：民國91-94年） 
• 衛生局所網路便民服務計畫（計畫期程：民國92-95年） 
• 國民健康資訊建設計畫（計畫期程：民國97-100年） 
• 加速醫療院所實施電子病歷系統計畫（計畫期程：民國99-101年） 

衛生署於102年改制為衛生福利部，資訊中心併同中醫藥委員會、內政部相關資訊業務及同仁成立為資訊處，規劃分四科辦事；本處除應用資通訊科技，整合衛生醫療及社會福利資訊業務，亦藉由資訊改造，提升機關之工作效能，積極提供民眾優質之資訊服務。本階段持續布建醫療院所實施電子病歷，提升健康資通訊共享及雲端化概念之運用。 

• 醫院實施電子病歷及互通補助計畫（計畫期程：民國102-104年） 
• 台灣健康雲計畫（計畫期程：民國102-104年） 
• 健康雲2.0計畫（計畫期程：民國105-108年） 
• 智慧健康雲計畫（計畫期程：民國109-112年） 

因應全球數位醫療轉型與人工智慧（AI）科技之發展，本處以「生態系願景」為核心，推動「國家級數位醫療平台333架構」，系統性建構臺灣智慧醫療之競爭力，包括爭取對醫療機構及中央機關之資訊建設資源。 

在平台建設層面，規劃「3大空間」：健康資料空間（THDS）、健康規則空間（THRS）、健康應用空間（THAS）。 

在資料標準層面，對齊「3大國際編碼標準」：實驗室檢驗與臨床觀察數據 LOINC、醫學術語編碼 SNOMED CT、藥物編碼 RxNorm。 

在人工智慧治理層面，成立「三大AI中心」：負責任AI執行中心、臨床AI取證驗證中心、AI影響性研究中心。 

• 次世代數位醫療平台計畫（計畫期程：民國113-116年） 
• 衛福數位基礎建設計畫（計畫期程：民國115-118年） 

資料治理與AI治理是推動智慧醫療的基石，醫療機構必須先建構完整且安全的資安環境，方能穩健導入智慧系統。本處於114年發布「醫院面對勒索軟體攻擊的應變指南」，為使各層級醫院均可以執行，並新增「分工及執行程序自我檢核表」；建置「高算力中心暨跨國聯邦學習平台」以厚植AI應用關鍵基礎，並明確定位為全國智慧醫療模型訓練與驗證之核心樞紐；115年發布衛生福利部「主權雲端八大指導方針」，強調在導入全球先進雲端技術的同時，必須守護國民數據資產的主權。 

智慧醫療的推動不只是技術創新，更是制度與治理能力的全面升級。本處期待透過這些政策輔導與治理架構，協助台灣醫療體系建立更高效、安全、永續的智慧醫療生態系。